重庆市委四届三次全会决定将全市划分为五大功能区,渝东北翼定为生态涵养发展区,是秦巴山区水源涵养重要区和三峡库区水源涵养重要区,渝东南翼定为生态保护发展区,是国家重点生态功能区与重要生态多样性保护区,即“两翼”回归国家重点生态功能区本位。
要使“两翼”生态保护可持续,其根本路径在于建立完善的生态补偿机制进而形成保护生态的永续内动力。因为保护生态所形成的生态环境服务（包括碳贮存、空气质量改善、水文改善、生物多样性等服务）无法阻止人们免费享受,这将造成:生态环境服务的需求者缺乏支付意愿,人人都指望“别人栽树自己乘凉”;生态环境服务的供给者缺乏供给内动力,因为无法阻止人们免费享受使其投入不能得到回报。
然而,如果“两翼”地区的生态保护不可持续带来生态环境服务缺失,不仅危及三峡库区和长江中下游地区的人们生存,而且会使全国的生态环境遭到破坏,所以必须寻求解决“两翼”地区生态保护内动力的途径,那就是建立完善的生态补偿机制。
两翼生态功能保护区的生态补偿机制建设是一项系统工程,涉及补偿谁、补偿多少、谁出资补偿和如何补偿等问题,解决这些问题又与各区域间和众多相关利益主体间的统筹协调、公平公正、权责利和共同发展等重大社会关系。从最基本的要求来看,应主要从以下几个方面着手:
确立生态补偿目标
按照建成长江流域生态屏障建设示范区的要求,两翼生态功能区通过生态补偿在5～8年内力争实现:（1）森林覆盖率,属粮食主产区应在45%-60%,非粮食主产区在60%以上。（2）三峡库区入口河流断面水质不低于Ⅲ级。
确定生态补偿对象
按照权利义务对称原则,生态补偿对象应当为两翼地区环境资源的所有权人或使用权人、保护建设与管理者,具体包括退耕还林工程建设的相关利益主体、森林和水源地的所有者与保护者、绿色产业企业主和矿山环境治理与生态恢复的建设主体等,即充分体现“谁拥有、谁保护、补偿谁”的激励原则。
明确生态补偿标准
对两翼生态功能区所进行的生态保护,其补偿标准应选择机会成本方法加以确定,即包括为保护两翼生态环境达标的所有直接投入和发展权受一定程度限制的代价。具体有:（1）生态保护直接投入,包括退耕还林工程建设、植树造林和封山育林、矿山环境治理与生态恢复建设、水质与水量监测、环境清洁与流域保护、水土流失治理、绿色生态产业建设和人口生态迁移安置等投入;（2）农户退出耕地的损失,这利用退耕面积和种植相关农作物的年产量及产品的价格就可计算得到;（3）发展权受限制的损失,由于两翼受生态保护的需要,关闭和拒绝了若干污染较重的企业,进而影响了两翼的经济发展,其损失可比照重庆市中等发展水平区县的人均量进行测算。
完善两翼地区生态补偿的实施机制
首先,争取和完善中央财政补偿。两翼生态功能区属于跨省的长江流域生态屏障建设,其生态保护所形成的生态环境服务从根本上讲是满足国家生态安全需求,因此中央财政理应承担两翼生态功能区的生态建设补偿。在当前我国的财政体制中,专项基金和财政转移支付制度对建立流域生态补偿机制具有重要的作用。在尝试建立三峡库区生态补偿基金的同时,应加大对两翼生态功能区的中央财政转移支付力度,通过各种生态建设项目进行补偿,如实施退耕还林、天然林资源保护、小流域治理、农业综合开发、扶贫开发、矿山环境治理与生态恢复建设、农村沼气、国家重点生态公益林管护等项目,以工程项目投资的形式支持两翼生态功能区的生态建设。
其次,完善市级财政补偿机制。重庆市级财政补偿主要是加大对两翼生态功能区中的区县,在生态环境保护方面的财政转移支付,增加预算内和国债项目投资安排份额,主要对节能工程项目、生态工业园项目等有资源高效利用项目、林业生态建设项目、水土保持工程项目、生态农业及新农村建设项目、矿山生态环境修复和环境保护、城镇环境保护工程投资方面进行倾斜,同时在税收方面对两翼区县进行部分减免,尤其是各区县产业结构调整过程中发展生态农业、高科技产业以及资源节约型生态产业予以所得税、增值税（市内分成部分）营业税、土地使用费等实行有限期的减免政策,以帮助两翼区县实行产业转型。
第三,建立跨行政区域的生态补偿机制。按照“着眼长远、形式多样、实现双赢”的基本原则,建立重庆与长江中下游跨行政区域的生态补偿机制。通过跨行政区域的生态补偿机制实施:（1）把两翼生态功能区建成长江流域生态屏障示范区,形成长江流域游经济一体化发展体系;（2）促进两翼生态功能区经济结构优化、产业布局合理,建立起生态旅游、特色农业、新型工业等具有较强竞争力和科技水平的产业体系,实现经济、社会和生态环境协调发展;（3）实现三峡库区与其下游地区之间资源共享、优势互补、协作联动、共同发展的双赢目标。
